В статье представлены результаты тематического анализа российских журналов Перечня ВАК, учредителями которых являются федеральные, национальные исследовательские и опорные вузы. С использованием Государственного рубрикатора научно-технической информации (ГРНТИ) показаны особенности распределения журналов по областям знаний на национальном уровне, для чего проведено сравнение тематических классов журнальной выборки как между группами журналов в зависимости от типа университета-учредителя, так и со всей совокупностью журналов ВАК. С использованием рубрикатора All Science Journal Classification (ASJC) приведены результаты тематического анализа изданий, индексируемых в библиографической системе Scopus, – для оценки научных направлений, наиболее представленных российскими университетскими журналами на международном уровне. Продемонстрировано общее доминирование журналов по общественным наукам, значительная часть которых включена в Scopus. Хорошо в России и за рубежом представлены российские вузовские журналы по отдельным направлениям естественных и точных наук. Слабо международному сообществу видны журналы по ряду направлений наук о жизни и почти не представлены издания по медицине и здравоохранению. Тематическое распределение журналов по типам вузов в целом соответствует миссии соответствующих учебных заведений. Детальное исследование предметных рубрик журналов может быть полезно при оценке потенциала развития периодических изданий, корректировке их тематики, принятии решений об открытии новых наименований по еще не охваченным дисциплинам.