Диалоги о статистике в научных публикациях
https://doi.org/10.24069/SEP-24-01
Аннотация
Проведен критический разбор статьи С. В. Мыльникова (Научный редактор и издатель. 2023;8(1 Suppl):S52–S61) в форме заочного диалога. Обсуждены такие аспекты, как частотнические и бейзовские точечные и интервальные оценки параметров биномиального и полиномиального распределений; коэффициента линейной корреляции (r); коэффициента детерминации (R2); параметров линейной регрессии; разности (PD) и отношения долей (RR); отношения шансов (OR); оценки минимально необходимых объемов выборок; преимущества статистического оценивания на основе бутстрепа; генератор случайных чисел; графические методы статистического анализа: коробы с декольте и с усами, вероятностные графики, гистограммы, графики Гарднера-Олтмена, дождевые облака; поправки на множественность сравнений; сложности корреляционного анализа; размер эффекта; вероятности воспроизведения (prep, psrep и prerep); значения mid-p; предсказательные интервалы для pзначений, для размеров эффекта и для суммарных эффектов в метаанализе. Представлено описание программ, рекомендуемых для решения обсуждаемых статистических задач
Об авторе
Н. Н. Хромов-Борисов
Комиссия по борьбе с лженаукой Экспертного совета РАН
Россия
Россия
Никита Николаевич Хромов-Борисов, кандидат биологических наук, старший научный сотрудник, член Комиссии по борьбе с лженаукой Экспертного совета РАН
г. Санкт-Петербург
Список литературы
1. Cumming G., Calin-Jageman R. Introduction to the New Statistics Estimation, Open Science, and Beyond. 2nd ed. Routledge; 2024. 610 p. https://doi.org/10.4324/9781032689470
2. Hopkins W. A new view of statistics. 2014. Available at: https://complementarytraining.net/wp-content/uploads/2013/10/Will-Hopkins-A-New-View-of-Statistics.pdf (accessed: 27.01.2024).
3. Мыльников С. В. Доверительные интервалы и точное значение p в научной статье в медико-биологическом журнале. Научный редактор и издатель. 2023;8(1 Suppl):S52–S61. https://doi.org/10.24069/SEP-23-13
4. Halverson M. S., Bolnick D. A. An ancient DNA test of a founder effect in Native American ABO blood group frequencies. American Journal of Physical Anthropology. 2008;137(3):342–347. https://doi.org/10.1002/ajpa.20887
5. Clopper C. J., Pearson E. S. The use of confidence or fiducial limits illustrated in the case of the binomial. Biometrika. 1934;26(4):404–413. https://doi.org/10.1093/biomet/26.4.404
6. Глотов Н. В., Животовский Л. А., Хованов Н. В., Хромов-Борисов Н. Н. Биометрия. Л.: Изд-во ЛГУ; 1982. 263 с.
7. Khurshid A., Ageel M. I. Binomial and Poisson confidence intervals and its variants: A bibliography. Pakistan Journal of Statistics and Operation Research. 2010;6(1):75–100. https://doi.org/10.18187/pjsor.v6i1.139
8. Мыльников С. В. Азы биометрии. СПб.: Издательство Н-Л; 2007. 56 с.
9. Haynes A. G., Lenz A., Stalder O., Limacher A. presize: An R-package for precision-based sample size calculation in clinical research. Journal of Open Source Software. 2021;6(60):3118. https://doi.org/10.21105/joss.03118
10. Hammer Ø., Harper D. A. T., Ryan P. D. PAST: Paleontological statistics software package for education and data analysis. Palaeontologia Electronica. 2001;4(1):4. Available at: http://palaeo-electronica.org/2001_1/past/issue1_01.htm (accessed: 27.01.2024).
11. Закс Л. Статистическое оценивание [Ю. П. Адлер, В. Г. Горкий (ред.); В. Н. Варыгин (пер.)]. М.: Статистика; 1976. 598 с.
12. Sachs L. Applied Statistics. A Handbook of Techniques. 2nd ed. New York: Springer; 1984. 707 p.
13. Spitzer M., Wildenhain J., Rappsilber J., Tyers M. BoxPlotR: a web tool for generation of box plots. Nature Methods. 2014;11(2):121–122. https://doi.org/10.1038/nmeth.2811
14. Ho J., Tumkaya T., Aryal S., Choi H., Claridge-Chang A. Moving beyond P values: Data analysis with estimation graphics. Nature Methods. 2019;16(7):565–566. https://doi.org/10.1038/s41592-019-0470-3
15. Allen M., Poggiali D., Whitaker K., Marshall T. R., van Langen J., Kievit R. A. Raincloud plots: a multiplatform tool for robust data visualization [version 2; peer review: 2 approved] Wellcome Open Research. 2021;4:63. https://doi.org/10.12688/wellcomeopenres.15191.2
16. JASP Team 2023. JASP (version 0.18.1). [Computes software]
17. Louis T. A., Zeger S. L. Effective communication of standard errors and confidence intervals. Biostatistics. 2009;10(1):1–2. https://doi.org/10.1093/biostatistics/kxn014
18. Мыльников С. В., Павлова Н. В., Барабанова Л. В. Антимутагенные эффекты синтетического пептида эпиталона у мышей, Mus musculus, различающихся по окраске шерсти. Экологическая генетика. 2011;9(3):75–88. https://doi.org/10.17816/ecogen9375-88
19. Глотов Н. В., Филатов А. А., Хромов-Борисов Н. Н. Сборник задач по биометрии. Л.: Изд-во ЛГУ; 1985. 81 с.
20. Мыльников С. В. Зависимость дисперсии выживаемости от возраста когорты у Drosophila melanogaster. Сообщение 1: Норма реакции выживаемости и ее наследование. Успехи геронтологии. 2018;31(3):323–329.
21. Sullivan G. M., Feinn R. S. Facts and fictions about handling multiple comparisons. Journal of Graduate Medical Education. 2021;13(4):457–460. https://doi.org/10.4300/JGME-D-21-00599.1
22. Bonett D. G., Wright T. A. Sample size requirements for estimating Pearson, Kendall, and Spearman correlations. Psychometrika. 2000;65(1):23–28. https://doi.org/10.1007/BF02294183
23. Gnambs T. A brief note on the standard error of the Pearson correlation. Collabra: Psychology. 2023;9(1):87615. https://doi.org/10.1525/collabra.87615
24. Федорова Е. М., Мыльников С. В. Нелегкий путь к диплому. СПб.: Изд-во Н-Л; 2012. 100 с.
25. Killeen P. R. An alternative to null hypothesis significance tests. Psychological Science. 2005;16(5):345–353. https://doi.org/10.1111/j.0956-7976.2005.01538.x
26. Lazzeroni L. C., Lu Y., Belitskaya-Lévy I. Solutions for quantifying P-value uncertainty and replication power. Nature Methods. 2016;13(2):107–108. https://doi.org/10.1038/nmeth.3741
27. Berry D. A p-value to die for. Journal of the American Statistical Association. 2017;112(519):895–897. https://doi.org/10.1080/01621459.2017.1316279
28. Campbell J. P. Editorial: Some remarks from the outgoing editor. Journal of Applied Psychology. 1982;67(6):691–700. https://doi.org/10.1037/h0077946
29. Geffré A., Concordet D., Braun J. P., Trumel C. Reference Value Advisor: A new freeware set of macroinstructions to calculate reference intervals with Microsoft Excel. Veterinary Clinical Pathology. 2011;40(1):107–112. https://doi.org/10.1111/j.1939-165X.2011.00287.x
30. Bornstein M. Common mistakes in meta-analysis and how to avoid them. Biostat, Inc. 2019. 409 p. Available at: https://meta-analysis.com/#downloadBookAndPaper (accessed: 27.01.2024).
31. Suurmond R., van Rhee H., Hak T. Introduction, comparison, and validation of Meta-Essentials: A free and simple tool for meta-analysis. Research Synthesis Methods. 2017;8(4):537–553. https://doi.org/10.1002/jrsm.1260
32. Borenstein M., Higgins J. P., Hedges L. V., Rothstein H. R. Basics of meta-analysis: I2 is not an absolute measure of heterogeneity. Research Synthesis Methods. 2017;8(1):5–18. https://doi.org/10.1002/jrsm.1230
33. Фишер Р. А. Математика дамы, дегустирующей чай. В кн.: Современные проблемы математики: сб. ст. М.: Знание; 1981. С. 46–58.
34. Cohen J. Things I have learned (so far). American Psychologist. 1990;45(12):1304–1312. https://doi.org/10.1037/0003-066X.45.12.1304
35. Хромов-Борисов Н. Н. Табличная форма описания статистических методов и программ в научных публикациях. Научный редактор и издатель. 2022;7(2)6:182–184. https://doi.org/10.24069/SEP-22-40
Рецензия
Для цитирования:
Хромов-Борисов Н.Н. Диалоги о статистике в научных публикациях. Научный редактор и издатель. 2024;9(1):1S5-1S32. https://doi.org/10.24069/SEP-24-01
For citation:
Khromov-Borisov N.N. Dialogues on statistics in scientific publications. Science Editor and Publisher. 2024;9(1):1S5-1S32. (In Russ.) https://doi.org/10.24069/SEP-24-01
Просмотров:
897
Послать статью по эл. почте 
